《指南》称，严控氮、磷肥产能盲目扩张，鼓励复混肥、专用肥和缓控释肥、生物肥、全水溶性肥料、液体肥料以及利用中低品位磷矿生产的新型肥料， 适度发展硝基肥料等多元肥料。鼓励发展资源节约、环境友好的农药新品种、新制剂、专用中间体、助剂以及清洁生产工艺和关键技术。

　　“十二五”期间将鼓励发展大颗粒尿素，积极研发和推广新型煤气化、净化和合成技术，减少对无烟块煤和天然气的过度依赖，5年内氮肥净增产能控制在100万吨左右； 将支持中低品位磷矿精选和利用技术，磷矿伴生资源综合利用技术、磷石膏综合利用技术、湿法磷酸净化技术等，2015年行业前十家企业的产量占总产量的60%，磷酸企业由90家减到50家，湿法磷酸净化替代热法磷酸150万吨，磷石膏利用率达到40%；钾肥重点增加钾肥产量，加大海水提钾和不溶性钾资源开发，建立国家钾肥储备制度。